Diese Kirche hat eine bewegte Geschichte. Sie wurde an der Stelle einer Kapelle aus dem 12. Jahrhundert erbaut und nach mehreren Bränden wiederaufgebaut.
Nach einem ersten Brand, der 1407 die Stadt und die Kapelle zerstört, wird eine neue Kirche gebaut. Doch nur wenige Jahre später wird die Kirche während der Burgunderkriege abermals Opfer der Flammen. Ihr Wiederaufbau dauert bis 1525. Nach langwierigen religiösen Streitigkeiten setzt sich 1554 der Protestantismus als Religion der Mehrheit der Einwohner durch. Guillaume Farel und Pierre Viret, der in Orbe geboren wurde, lesen hier die Predigt.
1688 werden umfassende Arbeiten durch einen dritten Brand unterbrochen. Bern und Freiburg beteiligen sich nun am Wiederaufbau. Heute besitzt die Kirche von Orbe trotz allem eine harmonische, stilistische Einheit.